Daftar Blog Saya

Sabtu, 15 Juni 2013

genome manusia dan sintesa protein



BAB I
PENDAHULUAN
Trigger 1
 Genom manusia dan sintesa protein

Sel dari organisme hidup mempunyai fungsi kehidupan seperti reproduksi , tumbuh kembang , metabolisme dan pertahanan terhadap pengaruh luar . didalam sel terdapat sejumlah besar molekul yang hidup yang disebut biomolekuler. didalam sel terdapat inti sel yang mengandung khromosom yang dibentuk dari rangkaian salah satu biomolekul yang disebut  DNA. Didalam DNA lah terdapat kumpulan kodon  yang menyusun kode genetik . Untuk sintesa protein diperlukan DNA dan berbagai jenis RNA.
Struktur dasar dari DNA dan RNA adalah inti purin, pyrimidin, fosfat, serta ribose deoksi ribose  yang dikelompokkan dalam struktur nukleosida, nukleotida , asam nukleat serta DNA dan RNA.
Bagaimana anda memahami genom manusia dan fungsinya untuk sintesa berbagai jenis protein jenis protain dan fungsi kehidupan.
Katabolisme purin menghasilkan asam urat, yang dapat menimbulkan batu ginjal, penumpukan disendi-sendi dan jaringan ikat yang disebut dengan penyakit gout.















STEP I : CLARIFY UNFAMILIAR TERM
Genome              :suatu kesatuan yang ada didalam sel
Kodon                   :penyusun kode genetik
Sintesa                 :pembentuk/penyusun molekul
Biomolekuler     :ilmu yang mempelajari struktur dan fungsi jasad hidup ditinjau dari kompunen jasad hidup
Katabolisma       :penguaraian molekul
Inti purin              :penyusun adenin dab guanin
Metabolisme     :pembentukan molekul
Pyrimidin             :basa nitrogen
Phospat               :asam basa
Ribose Deoksi    :gula dalam DNA
Nukleotida          :penambahan gula pada nukleosida
Nukleat                                :asam basa
Nukleosida         :terdisi dari basa dan fosfat
DNA                       :sintesa protein
RNA                       :sintesa lipid
STEP II : DEFINE THE PROBLEM
1.       Struktur DNA dan RNA,fungsi?
2.       Perbedaan DNA dan RNA?
3.       Apa itu sintesa protein?
4.       Pengertian kromosom?
5.       Kenapa katabolisme purin menghasilkan asam urat?
6.       Penyusun kode genetik?
7.       Defenisi biomolekuler?
8.       Batasan biomolekuler?
9.       Organel sel dan fungsi?
10.   Bagaimana metabolisme purin dan pirymidin?
11.   Bagaimana efek peningkatan asam urat dalam tubuh manusia
12.   Struktur nukleosida,nukleotida dan asam nukleat

STEP III : BRAINSTORM POSSIBLE HYPOTHESIS OR EXPLANATION
1.       DNA
Purin:adenin & guanin
Pirymidin:sitosin & timin
Gugus fosfat (dua deoksiribosa)
Fungsi:pewarisasn sifat dan sintesa protein
RNA
Purin:adenin & guanin
Pirymidin:sitosin dan urasil
Gugus fosfat 5 karbon( ribosa)
Fungsi :pengiriman informasi dari DNA
2.       Perbedaan DNA dan RNA
-          DNA
Bentuk rantai ganda/double helix
Basa nitrogen:
o   Purin             : adenin dan guanin
o   Pirimidin      : sitosin dan Timin
-          RNA
                Bentuk rantai tunggal/tidak bercabang
                Basa nitrogen:
o   Purin             : adenin dan guanin
o   Pirimidin      : Sitosin dan Urasil
3.       Sintesa protein
Adalah pembentukan protein dari monomere peptida disusun oleh DNA dan RNA

Proses sintesis protein
1.               (menyalin)
DNA ---- > mRNA---- >kode pasangan pada rantai sense DNA ----- >meninggalkan nukleuss menuju sitoplasma
2.               Translasi( Penerjemah)
Asam anino------ >Ribosom-------> tRNA------- >membawa asam amino sesuai kodon
4.       Pengertian kromosom
Krom=warna
Soma=badan
5.       Metabolisme purin menghasilkan asam urat
Karena disebabkan manusia mengubah adenosin dan guanin menjadi asam urat tidak seperti mamalia lainnya.
6.       Penyusun kode etik
- Adenin
- Guanin
- Sitosin
- Timin
- Urasil
7.       Defenisi biomolekuler
Adalah ilmu yang mempelajari tentaang fungsidan struktur jasad hidup ditinjau dari komponen jasad hidup
8.       Batasan biomolekuler
Secara sempit yaitu ilmu yang mempelajari mengenai organisasi dan regulasi sel pada cakupan molekul.
9.       Organel sel dan fungsi
- membran sel   : pengatur transpor zat keluar / masuk
- nukleus             : pengatur koordinasi sel
- sitoplasma        : membantu dalam penyediaan energi bagi sel
- ribosom             : sintesis protein
- lisosom              : pencernaan sel
- badan golgi      : distribusi protei yang sudah jadi
- sentriol              : pembelahan inti sel
- mitokondria     : penghasil ATP
- vakuola              : cadangan makanan
- RE kasar             : sintesis protein
-RE halus              : sintesis lipid


STEP IV : ARRANGE THE EXPLANATION INTO A TENTATIVE SOLUTION

STEP V : DEFINE LEARNING OBJECTIVE
1.       Organel sel  dan fungsinya
2.        Biomolekul sel
a.       Struktur Nukleosida, Nukleotida, dan Asam nukleat
b.      Struktur DNA dan RNA
c.       Fungsi DNA dan RNA
sintesis protein
d.      Perbedaan
3.       Metabolisme Purin dan Pirimidin
4.       Efek peningkatan Asam Urat dalam tubuh manusia
5.       Sintesa Protein


STEP VII : SHARE THE RESULT INFORMATION AND GATHERING PRIVATE STUDY
1.    Organel sel
- membran plasma
- nukleus
- nukleolus
- nukleoplasma
- sitoplasma
- Ribosom
-Retikulum endoplasma
-Mitokondria
-Plastida
-Badan golgi
-sitoskeleton
-sitosol
Organel yang berperan dalam sintesa DNA & RNA
-Nukleus
-Ribosom
-Sitosol
-Retikulum endoplasma
2.     Biomolekul sel
a)      Struktur Nukleosida, Nukleotida, dan Asam nukleat
o  NUKLEOSIDA
o   Nukleosida merupakan sebutan untuk bagian dari nukleotida tanpa gugus fosfat.
o   nukleosida tersusun dari gula ribosa atau deoksiribosa dan basa nitrogen.
o   Nukleosida merupakan kerangka dasar bagi terbentuknya AMP, ADP, dan ATP.
o   Proses pembentukan ketiga senyawa pembawa energi kimia ini biasanya terjadi di mitokondria sebagai bagian dari reaksi katabolisme/respirasi.
basepair
o      NUKLEOTIDA
o   Nukleotida merupakan struktur pembentuk inti sel - DNA dan RNA yang penting untuk perkembangan sel, fungsi-fungsi tubuh dan penggantian jaringan yang rusak.
o   Nukleotida tersebut terdapat di semua sel tubuh. 
o   Nukleotida juga berperan dalam metabolisme sel.
o   Contohnya saja nukleotida jenis Adenosin triposphat, yang merupakan pembawa energi utama ke dalam sel tubuh.
o   Sel tubuh tidak akan berfungsi tanpa nukleotida ini.
o   Nukleotida juga berfungsi untuk membantu sintesa lemak, karbohidrat, dan protein.
o     Asam Nukleat
·         Asam Nukleat terdiri dari : nukleotida yang berisi basa, gula dan fosfat.
·         Struktur Asam Nukleat :
-          Polimer dari 4 nukleotid yang saling dihubungkan dengan ikatan gula phospat.
-          RNA : ribosa  dan Purin ( adenin & guanin ) Pirimidin ( cytosin & urasil )
-          DNA : Deoxyribose dan Purin ( adenin & guanin ) Primidin ( cytosin & timin)
Nukleotida2
b)        Struktur DNA dan RNA
·         Struktur  DNA
-          Untai ganda disusun polinukleosida yang berpilin berorientasi berlawanan
Rantai satu berorietasi 5’-3’
Rantai lain 3’-5’
-Ikatan hidrogen antara A – T antara G – C
-Ikatan A-T berupa dua ikatan hidrogen
-Ikatan G-C berupa tiga ikatan hidrgen
-Kerangka gula deoksiribosa dan fosfat terletak dibagian luar
-Basa purin dan pirimidin terletak disebelah dalam urutan helix
-Diameter untaian DNA 20 A
-Pasangan basa berurutan bergerak 3,4 A berotasi sebesar 36 derajat berulang setiap 10 basa
-Dua lekukan eksternal yaitu lekukan besar dan lekukan kecil.
·         Struktur RNA
-bentuk ran rantai pendek dan tunggal
-basa nistrogen
                Purin                     : adenin dan guanin
                Pirimidin              :sitosin dan urasil
c)         Fungsi DNA dan RNA
-DNA
        Berhubungan dengan pewarisan sifat dan sintesis protein
-RNA
        Berhubungan dengan sintesis protein





d)        Perbedaan DNA dan RNA

DNA
RNA
Letak
Dalam inti sel,mitokondria ,kloroplas,sentriol
Dalam sel,sitoplasma,ribosom
Bentuk
Polinukleotida ganda dan panjang
Polinukleotida tunggal dan pendek
Gula
deoksiribosa
Ribosa
Basa
Golongan purin:adenin dan guanin.
Golongan pirimidin :sitosin dan urasil
Golongan purin:adenin dan guanin.
Golongan pirimidin:sitosin dan urasil.
Fungsi
Mengontrol sifat yang menurun
Sintesis protein
Sinteris RNA
Sintesis protein
Kadarnya
Tidak dipengaruhi sintesis protein:
Letak basa nitrogen dari kedua pita DNA saling berhadapan dengan pasangan yang tetap  yaitu adenin selalu berpasangan dengan timin .sitosin dengan guanin .kedua pita itu diikatkan oleh ikatan hidrogen
Dipengaruhi sintesis protein
Macam RNA:
ARN duta
ARN ribosom
ARN transfer




3.         Metabolisme Purin dan Pirimidin
KATABOLISME PURIN
  • Adenosin → Inosin → Hiposantin → Santin → Asam Urat
  • Guanosin → Guanin → Santin → Asam Urat
  • Santin oksidase adalah enzim yang merubah santin → asam urat, enzim tsb banyak terdapat di: hati, ginjal, usus halus
  • Penyakit Gout (pirai) ditandai oleh tingginya asam urat dalam tubuh, sehingga terjadi penimbunan dibawah kulit berbentuk tophi













KATABOLISME PIRIMIDIN
  • Sitosin → Urasil → Dihidrourasil → Asam β ureidopropionat → CO2 + NH3
  • Timin → Dihidrotimin → Asam β ureidoisobutirat → CO2 + NH3
  • Katabolisme pirimidin terutama berlangsung di hati

4.         Efek peningkatan Asam Urat dalam tubuh manusia
Manusia mengkatabolisme purin dari asam urat karena mengubah adenosin dan guanin menjadi asam urat.Peningkatan asam urat akan menyebabkan penumpukan kristal asam urat seperti pada sendi akan mengakibatkan nyeri,pada ginjal akan menyebabkan batu ginjal.
5.         Sintesa Protein
1.Transkripsi
Tahap pencetakan ARN duta oleh DNA dalam inti sel.
ini kami berikan imaginasi sederhana bagaimana sistem kerjanya DNA melakukan
Langkah-langkah transkripsi:
Pita double heliks membuka dengan bantuan enzim RNA Polimerase (berbentuk holoenzim) Pembentukkan RNA d dengan basa nitrogen yang komplementer dengan salah satu dari pita DNA

2.Translasi
Proses penterjemahan kodon dalam ARNd menjadi asam-asam amino oleh ARN transport di dalam sitolasma, proses perakitan asam-asam amino oleh ARNr oleh ribosom. 

Langkah-langkah translasi:
Tiga basa nitrogen dari RNA t yang disebut antikodon berpasangan dengan 3 basa nitrogen dari RNA d yang disebut kodon

ARN t berikutnya datang untuk berpasangann dengan kodon ARN d berikutnya. Asam amino pertama lepas dari ARN t dan berangkai dengan asam amino yang datang berikutnya

Perangkaian asam amino dilakukan oleh RNAr untuk membentuk protein tertentu
Asam amino ----> peptida ----> polipeptida ----> protein

ARN t yang datang pertama lepas dari ARN d dan bebas kembali ke sitoplasma



BAB III
PENUTUP
KESIMPULAN
Struktur sel terdapat inti sel yang mengandung kromosom yang dibentuk dari rangkaian salah satu biomol yang disebut DNA dimana didalamnya terdapat kodon yang menyusun kode genetik dimana sel tersebut sangat penting perannya yaitu melakukan reproduksi tumbuh kembang ,metabolisme dan pertahanan terhadap pengaruh luar sehingga suatu organisme bisa melangsungkan kehidupan dengan bantuan sel tersebut.

DAFTAR PUSTAKA

Yuwono,tribowo.2005.biologi molekuler.jakarta:erlangga

Tidak ada komentar:

Posting Komentar